Računalna igra Phylo napreduje u zdravstvenim istraživanjima

Inovativno istraživanje korištenjem internetske video igre spaja ljude s računalima kako bi se poboljšalo znanstveno znanje o genetskim osnovama bolesti poput Alzheimerove bolesti, dijabetesa i raka.

Igru nazvanu Phylo razvili su informatičar dr. Jérôme Waldispuhl sa Sveučilišta McGill i suradnik Mathieu Blanchette 2010. godine.

Phylo je osmišljen kako bi igračima neobaveznih igara omogućio doprinos znanstvenim istraživanjima uređivanjem višestrukih sekvenci obojenih blokova koji predstavljaju ljudsku DNK. Uvidom u sličnosti i razlike između ovih DNA sekvenci, znanstvenici su u mogućnosti steći novi uvid u razne genetski utemeljene bolesti.

Tijekom prošle godine 17 000 registriranih korisnika Phylo-a moglo je jednostavno igrati igru ​​iz zabave ili odlučiti pomoći u dekodiranju određene genetske bolesti.

"Mnogi su ljudi rekli da uživaju igrajući igru ​​koja bi mogla pomoći u pronalaženju podrijetla određene bolesti poput epilepsije", rekao je Waldispuhl.

"Puno je uzbuđenja u ideji da istovremeno igramo igru ​​i doprinosimo znanosti", složila se Blanchette. "To je igranje bez krivnje; sada možete sebi reći da nije samo izgubljeno vrijeme. "

Waldispuhl i njegovi studenti došli su na ideju da pomoću video igre riješe problem poravnavanja višestrukih sekvenci DNA, jer je to zadatak koji računala teško mogu dobro izvesti.

“Postoje neki proračuni koje ljudski mozak čini učinkovitije nego što to može bilo koje računalo. Prepoznavanje i sortiranje vizualnih uzoraka spada u tu kategoriju ”, objasnio je Waldispuhl.

“Računala najbolje rade s velikom količinom neurednih podataka, ali tamo gdje nam je potrebna velika preciznost trebaju ljudi. U ovom su slučaju genomi koje analiziramo već unaprijed poravnali računala, ali postoje dijelovi koji su pogrešno poravnati. Cilj nam je identificirati te dijelove i transformirati zadatak njihovog poravnavanja u zagonetku koju će ljudi htjeti riješiti. "

Otkako je igra pokrenuta u studenom 2010., istraživači su dobili više od 350 000 rješenja za probleme s redoslijedom poravnanja.

„Phylo je pridonio poboljšanju našeg razumijevanja regulacije 521 gena uključenih u razne bolesti. Također potvrđuje da se teški računski problemi mogu uklopiti u neobaveznu igru ​​koju ljudi mogu lako igrati bez ikakvog znanstvenog obrazovanja “, rekao je Waldispuhl.

"Ovo što mi ovdje radimo razlikuje se od klasičnog pristupa građanskoj znanosti. Ne zamjenjujemo ljude računalima niti tražimo od njih da se natječu sa strojevima. Oni rade zajedno. Sinergija ljudi i strojeva pomaže u rješavanju jednog od temeljnih bioloških problema. "

Izvor: Sveučilište McGill