Nova studija o šizofreniji usredotočena je na interakcije proteina i proteina

Slično kao i kod ljudi, o genu se može mnogo naučiti gledajući tvrtku koju drži i gledajući kako se ponaša. U pokušaju da otkriju više tragova o razvoju shizofrenije, istraživači sa Medicinskog fakulteta Sveučilišta Pittsburgh istraživali su kako proteini proizvedeni genima povezanim sa shizofrenijom međusobno djeluju.

"Možemo zaključiti što bi protein mogao učiniti provjerom tvrtke koju drži", rekao je viši istražitelj dr. Madhavi Ganapathiraju, docent za biomedicinsku informatiku s Medicinskog fakulteta Pitt.

“Na primjer, ako znam da imate mnogo prijatelja koji igraju hokej, to bi moglo značiti da ste i vi uključeni u hokej. Slično tome, ako vidimo da nepoznati protein, na primjer, komunicira s više proteina koji su uključeni u neuronsku signalizaciju, postoji velika vjerojatnost da je i nepoznati entitet uključen u isti. "

U novijoj povijesti znanstvenici su proveli mnoga istraživanja povezanosti genoma (GWAS) koja su uspješno identificirala varijante gena povezane s povećanim rizikom za shizofreniju. Međutim, relativno se malo zna o proteinima koje ti geni stvaraju, što rade i kako komuniciraju, kažu istraživači.

"Studije GWAS-a i drugi istraživački napori pokazali su nam koji bi geni mogli biti relevantni za shizofreniju", rekao je Ganapathiraju. „Ono što smo učinili je sljedeći korak. Pokušavamo shvatiti kako su ti geni međusobno povezani, što bi nam moglo pokazati biološke putove koji su važni za bolest. "

Ukratko, svaki gen stvara proteine, a ti proteini obično međusobno komuniciraju u biološkom procesu. Proučavanje kako se ti proteini ponašaju jedni s drugima može rasvijetliti ulogu gena koji još nije proučavan, otkrivajući putove i biološke procese povezane sa shizofrenijom, kao i njegov odnos s drugim složenim bolestima.

Nakon razvoja i upotrebe novog računalnog modela, nazvanog High-Precision Protein Interaction Prediction (HiPPIP), istraživači su otkrili više od 500 novih interakcija proteina i proteina (PPI) povezanih s genima povezanim sa shizofrenijom.

Istraživači dodaju da dok su se geni povezani sa shizofrenijom identificirani u povijesti i putem GWAS-a imali malo preklapanja, model je pokazao da dijele više od 100 zajedničkih interaktora. Nalazi bi mogli dovesti do boljeg razumijevanja bioloških osnova ove mentalne bolesti, kao i ukazati na put liječenja.

Nalazi su objavljeni na mreži u npj šizofrenija, časopis Nature Publishing Group.

Izvor: Škole zdravstvenih znanosti Sveučilišta u Pittsburghu