Tehnologija video igara unapređuje istraživanje raka

Novi trend u znanstvenim istraživanjima je uporaba tehnologije videoigara za simulaciju ljudskog tkiva.

Istraživači sa Sveučilišta Wake Forest koriste jedinice za obradu grafike (GPU), tehnologiju koja čini slike videoigara toliko realističnima, da simuliraju unutarnji rad ljudskih stanica.

Dr. Samuel Cho, biofizičar i informatičar, rekao je da je popularnost video igara također božji dar u smanjenju cijena GPU-a tako da se sada mogu koristiti za istraživanje.

Nadalje, tehnologija sada omogućava Chou da vidi točno kako stanice žive, dijele se i umiru. A to, rekao je, otvara mogućnosti za nove mete za lijekove koji ubijaju tumore.

Choova najnovija računalna simulacija kritične molekule RNA koja je komponenta ljudskog enzima telomeraze, osvjetljava ranije nepoznata skrivena stanja u preklapanju i odvijanju ove molekule.

Rezultati njegovog istraživanja pojavljuju se u Časopis Američkog kemijskog društva.

Enzim humane telomeraze nalazi se samo u stanicama karcinoma. Dodaje sitne molekule zvane telomere na krajeve DNA lanaca kada se stanice dijele - u biti sprječavajući stanice da umru.

"Stanica se neprestano reproducira, a to je sama definicija raka", rekao je Cho. "Znajući kako se telomeraza savija i funkcionira, pružamo novo područje za istraživanje liječenja karcinoma."

Vizualni prikaz daje znanstvenicima daleko precizniji uvid u to kako molekula funkcionira. To, pak, može omogućiti razvoj novih lijekova koji mogu blokirati djelovanje enzima i potencijalno zaustaviti rast stanica karcinoma.

Točnije, novi lijek zaustavio bi dodavanje enzima humane telomeraze na DNA, tako da tumorska stanica umire.

Cho trenutno istražuje upotrebu tehnologije videoigara za istraživanje bakterijskog ribosoma - molekularnog sustava 200 puta većeg od molekule ljudskog enzima telomeraze RNA.

Njegova istraživačka skupina počela je koristiti grafičke kartice nazvane GPU za izvođenje ovih simulacija stanica, što je mnogo brže od uobičajenog računanja.

"Oteli smo ovu tehnologiju za izvođenje simulacija vrlo, vrlo brzo na mnogo većim biomolekularnim sustavima", rekao je Cho.

Bez GPU-a, Cho je procijenio da bi mu trebalo više od 40 godina da programira tu simulaciju. Nevjerojatno je da će upotreba tehnologije omogućiti istraživanje u samo nekoliko mjeseci.

Izvor: Sveučilište Wake Forest