Nedostaju geni vjerojatnije onima s autizmom
To znači da su te osobe - 7 posto studijske skupine - imale jednu kopiju jednog ili više gena kad su trebale imati dva, primijetili su istraživači s Medicinskog fakulteta Icahn na Mount Sinai u New Yorku.
"Ovo je prvo otkriće da se čini da su male delegacije koje utječu na jedan ili dva gena česte kod autizma, te da ta brisanja doprinose riziku od razvoja poremećaja", rekao je vodeći istraživač studije, dr. Joseph D. Buxbaum, dr. Sc. , profesor psihijatrije, genetike i genomskih znanosti i neuroznanosti.
"Ovaj zaključak treba proširiti na druge neovisne uzorke ASD-a kako bismo uistinu mogli razumjeti kako se rizik manifestira."
Prema Buxbaumu, taj je postupak sada u tijeku. Konzorcij za sekvenciranje autizma, koji se sastoji od više od 25 institucija, dobio je potporu od 7 milijuna američkih dolara od strane Nacionalnog zavoda za zdravstvo za nastavak analize genoma tisuća osoba s ASD-om na planini Sinaj.
Autizam, koji pogađa oko 1 posto populacije, razvojni je poremećaj za koji se smatra da je uzrokovan složenom interakcijom genetskih i okolišnih čimbenika. Iako se poremećaj može naslijediti, prema Buxbaumu većina slučajeva autizma ne može se pripisati poznatim nasljednim uzrocima.
Iako su istraživanja pokazala da može postojati čak 1.000 gena ili genomskih regija koja doprinose autizmu, većina studija je tražila ili mutacije u jednoj točki - promjenu u jednom slovu DNA na genu - ili za velika područja genoma , koji obuhvaća mnoge gene, to je izmijenjeno.
Za svoje istraživanje, istraživači su skenirali genom stotina pojedinaca koristeći tehnologiju sekvenciranja gena. Tražili su varijaciju broja malih kopija - brisanje ili umnožavanje gena - između osoba s autizmom i kontrolne skupine ljudi bez poremećaja.
Za provođenje studije koristili su sekvenciranje exomea kako bi pogledali svih 22 000 ljudskih gena u skupu uzoraka. Zatim su analizirali te podatke pomoću programa eXome Hidden Markov Model (XHMM). Zajedno, alati su prvi koji mogu pronaći pojedinačne delecije ili dodatke veličine gena u genomu, prema istraživačima.
"To nam prvi put daje moć da pokrenemo jedan test iz uzorka krvi i usporedimo ga s referentnim genomom kako bismo tražili mutacije i varijacije broja malih kopija kod pacijenata", objasnio je Buxbaum.
Istraživači su analizirali bazu podataka koja se sastojala od 431 slučaja autizma i 379 podudarnih kontrola, ukupno 811 osoba. Pronašli su 803 brisanja gena u autističnoj skupini i 583 delecije u kontrolnoj skupini. Također su otkrili da oni s autizmom imaju veću vjerojatnost da će imati više malih brisanja.
"Sada je poznato da je nesavršeni broj kopija gena jedan od glavnih izvora varijabilnosti među ljudima", rekao je Buxbaum.
“Jedan od razloga zbog kojih se međusobno razlikujemo je zbog dodavanja ili brisanja gena, koji se često nasljeđuju. Ali od dodatnih brisanja koja vidimo u ASD-u, nisu sva posljedica genetskog nasljeđa. Neke se pojave tijekom razvoja jajne stanice ili sperme, a delecije koje se razvijaju na taj način obično su povezane s poremećajem. "
Istraživači su otkrili da je značajan udio brisanja gena kod onih s autizmom povezan s autofagijom, postupkom koji stanice održava zdravim zamjenom membrana i organela.
"Postoji dobar razlog za vjerovanje da je autofagija doista važna za razvoj mozga, jer mozak proizvodi mnogo više sinapsi nego što je potrebno, a višak treba orezati", rekao je Buxbaum. „Previše ili premalo sinapsa ima isti učinak da komunikacija ne funkcionira baš najbolje. To bi moglo značiti da neke sinaptičke veze dolaze prekasno i možda se neće učvrstiti kako treba. "
Istraživači kažu da vjeruju u nalaze objavljene u Američki časopis za humanu genetiku, imat će klinički značaj.
"Varijacije broja ključnih kopija - one koje se stalno pojavljuju u autističnoj populaciji - mogu utjecati na genetsko testiranje", zaključio je Buxbaum.
Izvor: Bolnica Mount Sinai / Medicinski fakultet Mount Sinai
